東漢延熹二年，恒帝劉志無能，大權已被奸臣粱冀把持二十年之久，其間國無寧日，民間疾苦不堪。毫州華佗不計名利、采藥治病，深受百姓愛戴。一日，玉匠倪玉不知何故被人追殺，他雖武藝高強，但寡不敵眾倒臥山中，幸遇華佗采藥至此，將其救回，并治愈了被毀掉的雙手。

皇宮內(nèi)苑皇太后宿疾復發(fā)，太醫(yī)束手無策。無奈之際皇妹柔柔公主與常待徐璜冒大不韙私出宮禁尋訪華佗。楊柳溝流行瘟疫，華佗與小徒吳普前往救治。

每每向病人索取巨資的道姑妙真子對華佗的到來十分仇視，為抵制華佗，妙真子向縣令誆說此次疫情非病，而是沈家堡主是雌雄同體所致，素來想謀算沈家財富的縣令中下懷，便將堡主沈蕓綁上了火刑臺。